Из многочисленных работ наиболее выдающиеся: «Zur Anatomie der Amphibien» (Берн, 1839); «Beiträge zur Neurologie der Reptilien» (Берн, 1840); «Embryologie des Salmones» (сост. 1-й том соч. Л. Агассиса, «Histoire naturelle des Poissons d’eau douce de l’Europe centrale», Нёвшатель, 1842); «Untersuchungen über die Entwicklungsgeschichte der Geburtshelferkröte (Alytes obstetricans)» (Солотурн, 1842); «Im Gebirg und auf den Gletschern» (там же, 1843); «Anatomie des Salmones» (вместе с Агассисом, «Mem. Soc. Sc. Nat.», Нёвшатель, 1845); «Lehrbuch der Geologie und Petrefactenkunde» (2 т., Брауншвейг, 1846, 5 изд. 1879); «Recherches sur l’embryogénie des Mollusques gastéropodes» («Ann. Sc. Nat." 1846); «Physiologische Briefe» (3 отд., Штутгарт, 1845–1846; 4-е изд. Гиссен, 1874); «Ocean und Mittelmeer» (2 т., Франкфурт, 1848); «Zoologische Briefe» (2 т., там же, 1851); «Naturgeschichte der lebenden und untergegangenen Thiere etc." (2 т., там же, 1851); «Untersuchungen über die Thierstaaten» (там же, 1851); «Bilder aus dem Thierleben» (там же, 1852); «Mémoire sur les Hectocotyles etc." (вместе с Верани, «Ann. Sc. Nat», 1852); «Köhlerglaube und Wissenschaft. Eine Streitschrift gegen Rudolph Wagner» (4-е изд., Гиссен, 1856); «Mémoire sur les Syphonophores de la mer de Nice» («Mem. Inst. Genevois», 1853); «Altes und Neues aus Thier- und Menschenleben» (Франкфурт, 1859); «Die Künstliche Fischzucht» (Лпц., 1859; 2-е изд. 1875); «Vorlesungen über nützliche und schädliche Thiere» (там же, 1865); «Vorlesungen über den Menschen» (2 т., Гиссен, 1864); «Mémoires sur les microcéphales ou hommes singes» («Mém. Inst. nat. Genevois», 1867); «Atlas der Zoologie» (33 табл., Лпц., 1875); «Die Herkunft der Eingeweidewürmer des Menschen» (Базель, 1877); «Die Säugethiere in Wort und Bild» (Мюнхен, 1883); «Lehrbuch der praktischen vergleichenden Anatomie» (вместе с Э. Юнгом, 2 т., Брауншвейг, 1888–1894); «Aus meinem Leben, Erinnerungen und Rückblicke» (Штутгарт, 1895). Большинство сочинений, за исключением монографий, переведено на русский язык.